В сентябре климат в Томске можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 11 градусов тепла. В среднем в сентябре в Томске 11 дождливых, 11 пасмурных, 5 ясных и 3 дня с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные.